Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms