Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DXG7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DXG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DXG7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DXG7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DXG7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DXG7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4DXG7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DXG7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DXG7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DXG7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4DXG7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DXG7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DXG7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DXG7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DXG7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DXG7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DXG7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DXG7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DXG7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DXG7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DXG7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DXG7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DXG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DXG7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4DXG7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
B4DXG7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DXG7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DXG7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DXG7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DXG7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DXG7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B4DXG7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DXG7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DXG7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B4DXG7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B4DXG7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DXG7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DXG7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DXG7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DXG7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B4DXG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DXG7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DXG7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DXG7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
B4DXG7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
B4DXG7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DXG7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DXG7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DXG7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DXG7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DXG7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DXG7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DXG7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B4DXG7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DXG7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DXG7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B4DXG7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DXG7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DXG7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DXG7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DXG7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DXG7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DXG7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DXG7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DXG7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DXG7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DXG7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DXG7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DXG7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DXG7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4DXG7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms