Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM229AB2RXF0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229AB2RXF0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1079.8 ms