Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8B2A6NJW9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD8B2A6NJW9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD8B2A6NJW9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms