Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB19A4D1S5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB19A4D1S5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB19A4D1S5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB19A4D1S5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAB19A4D1S5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB19A4D1S5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB19A4D1S5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB19A4D1S5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms