Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC78A2IDD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC78A2IDD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC78A2IDD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms