Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPVL1A0A0U1RR11 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPVL1A0A0U1RR11 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms