Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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