Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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