Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H8

IGKV1D-42, Immunoglobulin kappa variable 1D-42 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-42A0A075B6H8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1D-42A0A075B6H8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1D-42A0A075B6H8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-42A0A075B6H8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms