Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms