Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms