Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms