Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG6Q9Y2V7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG6Q9Y2V7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms