Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF3AQ9Y2N7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIF3AQ9Y2N7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms