Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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