Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLA2G4CQ9UP65 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLA2G4CQ9UP65 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms