Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms