Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
COPS3Q9UNS2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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COPS3Q9UNS2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS3Q9UNS2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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