Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PACSIN3Q9UKS6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms