Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHORDC1Q9UHD1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms