Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms