Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM5BQ9UGL1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms