Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms