Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VTI1BQ9UEU0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms