Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK4Q9UBT3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms