Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms