Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMG20BQ9P0W2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms