Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPHK1Q9NYA1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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