Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DDIT4Q9NX09 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms