Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OXSMQ9NWU1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms