Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT84Q9NSB2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms