Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA4BQ9NPR2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms