Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms