Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LNPKQ9C0E8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms