Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms