Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPL3Q9BY60 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms