Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARD11Q9BXL7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms