Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms