Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms