Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDRT15Q96T59 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms