Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms