Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms