Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIC2Q96JB3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms