Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms