Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms