Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms