Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms