Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSR2Q969E8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSR2Q969E8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms