Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FRAT1Q92837 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms